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基于生物信息学技术筛选结直肠癌的差异基因和中药预测研究 [技术] \| 贠张君#王慧静#俞仪萱#孙梓宜#姚树坤 \| 《1.北京中医药大学；2.中日友好医院消化内科》 \| 2023-02-28 \| 浏览：305 摘要：通过生物信息学技术筛选并分析结直肠癌(colorectal cancer,CRC)与正常组织的差异基因,预测可用于诊断和治疗 CRC 的生物标志物及中药。从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取 GSE21815、GSE106582、GSE41657 基因芯片,应用 GEO2R 工具获取差异表达基因( differentially expressed genes,DEGs);应用 DAVID 数据库对 DEGs 进行基因本体论 (Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;通过 STRING 数据库构建蛋白-蛋白互作网络,应用 MCODE、 CytoHubba 插件筛选网络中显著模块及关键基因;分别应用 UCSC、 cBioPortal、 Oncomine 在线数据库对关键基因进行分层聚类、生存分析、Oncomine 分析和临床资料相关性分析;应用 Coremine Medical 数据库预测作用于关键基因的中药。共筛选出 284 个 DEGs,其中 146 个上调基因,138 个下调基因。上调基因显著富集在细胞周期、NLRs 通路、TNF 信号通路等途径;下调基因显著富集在矿物质吸收、氮代谢、碳酸氢盐在近端小管重吸收等通路。 15 个关键基因为 CDK1、CDC20、AURKA、MELK、TOP2A、PTTG1、BUB1、CDCA5、CDC45、TPX2、NEK2、CEP55、CENPN、TRIP13、GINS2, 其中 CDK1 和 CDC20 被视为核心基因。 CDK1 和 CDC20 的高表达有着较差的生存预后,并且它们在多种癌症中显著表达,尤其是乳腺癌、肺癌、CRC;CDK1 和 CDC20 的表达与性别、肿瘤类型、TNM 分期、KRAS 基因突变具有相关性。预测出治疗 CRC 的潜在中药代表药物有黄芩、半枝莲、紫草等。 CDK1 和 CDC20 的显著表达有助于区分肿瘤组织和正常组织,并与生存预后有关,有望成为诊断和治疗 CRC 的生物标志物,该研究为将来新型药物的开发提供参考方向。关键词：结直肠癌生物信息学差异表达基因中药预测下载阅读收藏
细胞生物信息学及技术 [技术] \| 顾宁#王方旭#李艳#汤天宇#曹晨#沈艳 \| 《1.东南大学生物科学与医学工程学院, 生物电子学国家重点实验室, 江苏省生物材料与器件重点实验室；2.南京医科大学生物医学工程与信息学院；3.东南大学医学院, 江苏省分子影像与功能影像重点实验室》 \| 2023-02-28 \| 浏览：373 摘要：细胞是生命体基本组成单位, 其性状与活动过程直接关乎生命体生理与病理. 近年来, 有关(单)细胞的研究突飞猛进. 细胞命运、操控及其生物医学应用首先必须有细胞信息获取与分析作为支撑, 但由于技术原理与方法等方面还存在许多难以克服的限制, 相关研究亟待突破. 本文简述了细胞生物信息学的由来与分类, 梳理了细胞生物信息获取与分析研究的主要进展, 并对未来的发展趋势与挑战进行了讨论关键词：细胞生物信息学单细胞分析图像处理谱学分析细胞温度下载阅读收藏
苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析 [技术] \| 尹桂芳#段迎#杨晓琳#蔡苏云#王艳青#卢文洁#孙道旺#贺润丽#王莉花 \| 《1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室；2.山西中医药大学中药与食品工程学院》 \| 2023-02-28 \| 浏览：483 摘要：克隆苦荞苯丙烷类物质代谢途径中的关键酶肉桂酸-4-羟基化酶基因（FtC4H），为进一步研究其功能奠定基础。以云荞 1 号和小米荞为材料，提取不同发育期果壳 RNA，利用 RT-PCR 法克隆苦荞 FtC4H 基因，运用生物信息学分析 FtC4H 蛋白的特征，构建 FtC4H 蛋白系统进化树，分析其基因表达。结果表明，克隆的 FtC4H 基因序列包含 1299bp 完整的 cDNA 开放阅读框，编码 432 个氨基酸，为亲水性不稳定碱性蛋白，具有 P450 超家族保守域，不具有跨膜结构域，有丰富的二级结构，三级结构预测显示 FtC4H 与 6vby.1.A 的序列相似度高。系统进化分析结果表明，本研究克隆的 FtC4H 与已报道的苦荞其他 C4H 基因不同。qRT-PCR 结果表明，FtC4H 在小米荞的花和叶中相对表达量显著高于云荞 1 号。关键词：苦荞 RT PCR 克隆肉桂酸 4 羟基化酶生物信息学分析实时荧光定量 PCR 下载阅读收藏
基于生物信息学技术探讨白及多糖对胃溃疡的保护机制及实验验证 [技术] \| 白敏#段永强#成映霞#马骏#李润法#赵琳娜#刘梦雅 \| 《1.甘肃中医药大学；2.甘肃省中医方药挖掘与创新转化重点实验室；3.宁夏医科大学》 \| 2023-02-28 \| 浏览：106 摘要：目的：基于生物信息学技术探讨白及多糖对胃溃疡的保护作用及机制，并进行实验验证。方法：利用GeneCards、OMIM等数据库对胃溃疡疾病相关靶点进行预测和筛选；通过String在线数据库进行蛋白互作分析；通过Cytoscape构建PPI网络，筛选核心靶点与白及多糖组分（葡萄糖、甘露糖）进行分子对接，60只大鼠随机分为空白组、模型组、阳性对照组和白及多糖高、低剂量组，各组大鼠分别给药干预7 d。除空白组外，其余大鼠全部通过盐酸/乙醇混合物复制胃溃疡模型。肉眼观察及病理检测评价大鼠胃组织损伤状况，并通过相关分子生物学技术对前期生物信息学技术预测得到的结果进行验证。结果：共筛选得到与胃溃疡密切相关的靶点56个，其中排名前3的是AKT、HIF-1α、HSP90，分子对接结果表明结合能皆<0。实验验证结果表明，与空白组比较，模型组大鼠胃组织溃疡性损伤显著，水肿充血坏死明显可见，镜下上皮细胞结构紊乱、坏死严重，病理学评分升高，AKT、HIF-1α、HSP90的基因蛋白表达水平均显著升高（P<0.01）；与模型组比较，白及多糖显著降低溃疡指数（P<0.01），有效改善胃组织病理评分，显著降低AKT、HIF-1α的基因蛋白表达水平，升高HSP90基因蛋白表达水平（P<0.01，P<0.05）。结论：白及多糖具有显著的胃保护作用，其具体机制可能是葡萄糖和甘露糖能够显著调控胃组织凋亡、炎症、缺氧等病理状态，同时还能有效激活HSP90等保护性蛋白，进而发挥抗溃疡性损伤作用。关键词：白及多糖蛋白激酶B 缺氧诱导因子 1 热休克蛋白90 胃溃疡生物信息学下载阅读收藏
生物信息学技术筛选乳腺癌他莫昔芬耐药关键基因及相关通路分析 [技术] \| 李雷雷#徐文漭#王光辉#杨举伦 \| 《1.昆明医科大学研究生院；2.中国人民解放军联勤保障部队第 920 医院病理科；3.贵州省人民医院乳腺外科》 \| 2023-02-28 \| 浏览：196 摘要：目的应用生物信息学技术筛选乳腺癌他莫昔芬耐药关键基因并分析相关通路，为预测乳腺癌潜在治疗靶点奠定基础。方法选取 NCBI-基因表达综合数据库( GEO) 中的基因表达芯片“GSE67916”和“GSE96670”，利用 GEO2Ｒ在线分析工具对乳腺癌他莫昔芬耐药样本和敏感样本中的差异基因进行筛选。利用 DAVID 和 KOBAS 在线工具对差异基因进行 GO 分析和 KEGG 分析。使用蛋白质－蛋白质相互作用( PPI) 分析 STＲING 数据库构建靶点互作网络模型。结果筛选了 132 个差异基因，包括 103 个上调基因和 29 个下调基因，通过 Cytoscape 确定 4 个关键基因: IFI27、IRF9、OAS1、ISG15。GO 分析显示差异基因主要参与细胞黏附、细胞质外泌体、蛋白结合功能。KEGG 分析显示差异基因主要参与内吞作用、癌蛋白多糖、雌激素信号通路。结论乳腺癌他莫昔芬耐药与 IFI27、IRF9、OAS1、ISG15 有关，其可作为乳腺癌治疗的潜在靶点。关键词：乳腺肿瘤生物信息学分析他莫昔芬耐药差异基因下载阅读收藏
基于生物信息学与分子对接技术对坛紫菜降血压肽的筛选及活性分析 [技术] \| 叶贤江#苏志琛#林晓娟#陈继承 \| 《福建农林大学食品科学学院》 \| 2023-02-28 \| 浏览：167 摘要：采用木瓜蛋白酶和糜蛋白酶双酶联合水解坛紫菜蛋白（Porphyra haitanensis protein，PHP）制备降血压活性肽，测定了经超滤后各个分子质量PHP酶解液清除1,1-二苯基-2-三硝基苯肼（1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl，DPPH）自由基和2,2’-联氮双(3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)（2,2’-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid)，ABTS）阳离子自由基能力、铁离子还原抗氧化能力（ferric ion reducing antioxidant power，FRAP）以及血管紧张素转化酶（angiotensin converting enzyme，ACE）抑制活性。经质谱鉴定和活性肽数据库BIOPEP以及AHTPDB网站查找筛选活性肽，采用分子对接解释多肽抑制ACE机理，并对双酶酶解PHP动力学进行研究。结果表明：经超滤后的8 个分子质量的坛紫菜多肽组分中，＜0.5 kDa的组分具有最高DPPH自由基和ABTS阳离子自由基清除能力，＜1 kDa的组分具有最高FRAP值，而0.5～1 kDa组分IC50值（（2.21±0.28）mg/mL）最低。经查找筛选出14 条降血压肽，其中4 条肽的序列和对接能量分别为AVP（－5.87 kJ/mol）、GPL（－6.13 kJ/mol）、LDY （－7.65 kJ/mol）和LGYL（－7.78 kJ/mol）。酶解动力学模型预测PHP水解度与实验水解度相对误差在10%以下。本实验基于串联质谱与分子对接技术，通过生物信息筛选和体外活性检测从混合多肽中快速鉴定、筛选活性多肽，探究多肽抑制ACE的机理，并建立了描述蛋白可控酶解过程规律的动力学模型，为活性肽的制备提供了参考和借鉴。关键词：坛紫菜血管紧张素转化酶抑制肽分子对接酶解动力学模型下载阅读收藏
生物信息学数据库在医学研究中的应用 [医学] \| 刘银凤#张雷 \| 《大理学院基础医学院病原生物学综合实验室》 \| 2022-12-23 \| 浏览：259 摘要：后基因组时代的到来，使生物信息学的应用范围更加广泛，生物信息学数据库种类不断增多，数量不断增加，功能日趋完善；在一次数据库的基础上大量的生物信息学二次数据库得到了开发和应用，推动了病毒分析、基因识别与预测以及疾病诊断等相关领域的发展。关键词：生物信息学数据库病毒基因疾病综述下载阅读收藏
从生物大数据到知识大发现: 十年进展与未来展望 [技术] \| 张学工#江瑞#汪小我#古槿#陈挺 \| 《清华大学自动化系》 \| 2022-12-01 \| 浏览：142 摘要：生物和医疗大数据的快速大量积累是当今生命科学领域的一个重要特征, 但从这些大数据能否获得关于生命现象规律的重大知识发现, 是人们更关心的关键问题, 也是2005年Science杂志展望的125个最具挑战性问题之一. 本文从新一代DNA测序技术发展以及医学遗传学、合成生物学、精准医学、微生物组学等几个方面, 回顾了近十年来生物大数据的重要发展和已经由此带来的科学进步, 并对未来的发展方向进行了展望。关键词：生物大数据基因组学生物信息学系统生物学组学下载阅读收藏
酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术研究进展及其在生物医学研究中的应用 [其他] \| 李凯旋#徐锋#徐平 \| 《河北大学生命科学学院，河北保定 071002》 \| 2022-11-03 \| 浏览：508 摘要：在酪氨酸磷酸化蛋白质组学的研究过程中，酪氨酸磷酸化位点的富集是最重要的一步。目前常用的富集方法是抗体亲和富集或 SH2 superbinder 富集。此外，通过质谱与生物信息学等技术，可实现大规模酪氨酸磷酸化位点的鉴定。对酪氨酸磷酸化蛋白质组学进行深度覆盖研究，揭示癌症发生发展过程中失调的激酶，将有助于深入理解癌症的发生发展过程；且由于 75%的致癌基因是酪氨酸激酶基因，酪氨酸激酶抑制剂作为抗癌药物受到了越来越多的关注。应用酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术，可以鉴定与癌症等重大疾病相关的酪氨酸激酶，从而帮助找到酪氨酸激酶抑制剂。总之，酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术可以在酪氨酸激酶鉴定、酪氨酸激酶抑制剂研究及酪氨酸磷酸化信号通路研究等生物医学领域中得到很好的应用。关键词：酪氨酸激酶酪氨酸磷酸化酪氨酸磷酸化肽段富集精准医学下载阅读收藏

基于生物信息学技术筛选结直肠癌的差异基因和中药预测研究 [技术] \| 贠张君#王慧静#俞仪萱#孙梓宜#姚树坤 \| 《1.北京中医药大学；2.中日友好医院消化内科》 \| 2023-02-28 \| 浏览：305 摘要：通过生物信息学技术筛选并分析结直肠癌(colorectal cancer,CRC)与正常组织的差异基因,预测可用于诊断和治疗 CRC 的生物标志物及中药。从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取 GSE21815、GSE106582、GSE41657 基因芯片,应用 GEO2R 工具获取差异表达基因( differentially expressed genes,DEGs);应用 DAVID 数据库对 DEGs 进行基因本体论 (Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;通过 STRING 数据库构建蛋白-蛋白互作网络,应用 MCODE、 CytoHubba 插件筛选网络中显著模块及关键基因;分别应用 UCSC、 cBioPortal、 Oncomine 在线数据库对关键基因进行分层聚类、生存分析、Oncomine 分析和临床资料相关性分析;应用 Coremine Medical 数据库预测作用于关键基因的中药。共筛选出 284 个 DEGs,其中 146 个上调基因,138 个下调基因。上调基因显著富集在细胞周期、NLRs 通路、TNF 信号通路等途径;下调基因显著富集在矿物质吸收、氮代谢、碳酸氢盐在近端小管重吸收等通路。 15 个关键基因为 CDK1、CDC20、AURKA、MELK、TOP2A、PTTG1、BUB1、CDCA5、CDC45、TPX2、NEK2、CEP55、CENPN、TRIP13、GINS2, 其中 CDK1 和 CDC20 被视为核心基因。 CDK1 和 CDC20 的高表达有着较差的生存预后,并且它们在多种癌症中显著表达,尤其是乳腺癌、肺癌、CRC;CDK1 和 CDC20 的表达与性别、肿瘤类型、TNM 分期、KRAS 基因突变具有相关性。预测出治疗 CRC 的潜在中药代表药物有黄芩、半枝莲、紫草等。 CDK1 和 CDC20 的显著表达有助于区分肿瘤组织和正常组织,并与生存预后有关,有望成为诊断和治疗 CRC 的生物标志物,该研究为将来新型药物的开发提供参考方向。关键词：结直肠癌生物信息学差异表达基因中药预测下载阅读收藏
细胞生物信息学及技术 [技术] \| 顾宁#王方旭#李艳#汤天宇#曹晨#沈艳 \| 《1.东南大学生物科学与医学工程学院, 生物电子学国家重点实验室, 江苏省生物材料与器件重点实验室；2.南京医科大学生物医学工程与信息学院；3.东南大学医学院, 江苏省分子影像与功能影像重点实验室》 \| 2023-02-28 \| 浏览：373 摘要：细胞是生命体基本组成单位, 其性状与活动过程直接关乎生命体生理与病理. 近年来, 有关(单)细胞的研究突飞猛进. 细胞命运、操控及其生物医学应用首先必须有细胞信息获取与分析作为支撑, 但由于技术原理与方法等方面还存在许多难以克服的限制, 相关研究亟待突破. 本文简述了细胞生物信息学的由来与分类, 梳理了细胞生物信息获取与分析研究的主要进展, 并对未来的发展趋势与挑战进行了讨论关键词：细胞生物信息学单细胞分析图像处理谱学分析细胞温度下载阅读收藏
苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析 [技术] \| 尹桂芳#段迎#杨晓琳#蔡苏云#王艳青#卢文洁#孙道旺#贺润丽#王莉花 \| 《1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室；2.山西中医药大学中药与食品工程学院》 \| 2023-02-28 \| 浏览：483 摘要：克隆苦荞苯丙烷类物质代谢途径中的关键酶肉桂酸-4-羟基化酶基因（FtC4H），为进一步研究其功能奠定基础。以云荞 1 号和小米荞为材料，提取不同发育期果壳 RNA，利用 RT-PCR 法克隆苦荞 FtC4H 基因，运用生物信息学分析 FtC4H 蛋白的特征，构建 FtC4H 蛋白系统进化树，分析其基因表达。结果表明，克隆的 FtC4H 基因序列包含 1299bp 完整的 cDNA 开放阅读框，编码 432 个氨基酸，为亲水性不稳定碱性蛋白，具有 P450 超家族保守域，不具有跨膜结构域，有丰富的二级结构，三级结构预测显示 FtC4H 与 6vby.1.A 的序列相似度高。系统进化分析结果表明，本研究克隆的 FtC4H 与已报道的苦荞其他 C4H 基因不同。qRT-PCR 结果表明，FtC4H 在小米荞的花和叶中相对表达量显著高于云荞 1 号。关键词：苦荞 RT PCR 克隆肉桂酸 4 羟基化酶生物信息学分析实时荧光定量 PCR 下载阅读收藏
基于生物信息学技术探讨白及多糖对胃溃疡的保护机制及实验验证 [技术] \| 白敏#段永强#成映霞#马骏#李润法#赵琳娜#刘梦雅 \| 《1.甘肃中医药大学；2.甘肃省中医方药挖掘与创新转化重点实验室；3.宁夏医科大学》 \| 2023-02-28 \| 浏览：106 摘要：目的：基于生物信息学技术探讨白及多糖对胃溃疡的保护作用及机制，并进行实验验证。方法：利用GeneCards、OMIM等数据库对胃溃疡疾病相关靶点进行预测和筛选；通过String在线数据库进行蛋白互作分析；通过Cytoscape构建PPI网络，筛选核心靶点与白及多糖组分（葡萄糖、甘露糖）进行分子对接，60只大鼠随机分为空白组、模型组、阳性对照组和白及多糖高、低剂量组，各组大鼠分别给药干预7 d。除空白组外，其余大鼠全部通过盐酸/乙醇混合物复制胃溃疡模型。肉眼观察及病理检测评价大鼠胃组织损伤状况，并通过相关分子生物学技术对前期生物信息学技术预测得到的结果进行验证。结果：共筛选得到与胃溃疡密切相关的靶点56个，其中排名前3的是AKT、HIF-1α、HSP90，分子对接结果表明结合能皆<0。实验验证结果表明，与空白组比较，模型组大鼠胃组织溃疡性损伤显著，水肿充血坏死明显可见，镜下上皮细胞结构紊乱、坏死严重，病理学评分升高，AKT、HIF-1α、HSP90的基因蛋白表达水平均显著升高（P<0.01）；与模型组比较，白及多糖显著降低溃疡指数（P<0.01），有效改善胃组织病理评分，显著降低AKT、HIF-1α的基因蛋白表达水平，升高HSP90基因蛋白表达水平（P<0.01，P<0.05）。结论：白及多糖具有显著的胃保护作用，其具体机制可能是葡萄糖和甘露糖能够显著调控胃组织凋亡、炎症、缺氧等病理状态，同时还能有效激活HSP90等保护性蛋白，进而发挥抗溃疡性损伤作用。关键词：白及多糖蛋白激酶B 缺氧诱导因子 1 热休克蛋白90 胃溃疡生物信息学下载阅读收藏
生物信息学技术筛选乳腺癌他莫昔芬耐药关键基因及相关通路分析 [技术] \| 李雷雷#徐文漭#王光辉#杨举伦 \| 《1.昆明医科大学研究生院；2.中国人民解放军联勤保障部队第 920 医院病理科；3.贵州省人民医院乳腺外科》 \| 2023-02-28 \| 浏览：196 摘要：目的应用生物信息学技术筛选乳腺癌他莫昔芬耐药关键基因并分析相关通路，为预测乳腺癌潜在治疗靶点奠定基础。方法选取 NCBI-基因表达综合数据库( GEO) 中的基因表达芯片“GSE67916”和“GSE96670”，利用 GEO2Ｒ在线分析工具对乳腺癌他莫昔芬耐药样本和敏感样本中的差异基因进行筛选。利用 DAVID 和 KOBAS 在线工具对差异基因进行 GO 分析和 KEGG 分析。使用蛋白质－蛋白质相互作用( PPI) 分析 STＲING 数据库构建靶点互作网络模型。结果筛选了 132 个差异基因，包括 103 个上调基因和 29 个下调基因，通过 Cytoscape 确定 4 个关键基因: IFI27、IRF9、OAS1、ISG15。GO 分析显示差异基因主要参与细胞黏附、细胞质外泌体、蛋白结合功能。KEGG 分析显示差异基因主要参与内吞作用、癌蛋白多糖、雌激素信号通路。结论乳腺癌他莫昔芬耐药与 IFI27、IRF9、OAS1、ISG15 有关，其可作为乳腺癌治疗的潜在靶点。关键词：乳腺肿瘤生物信息学分析他莫昔芬耐药差异基因下载阅读收藏
基于生物信息学与分子对接技术对坛紫菜降血压肽的筛选及活性分析 [技术] \| 叶贤江#苏志琛#林晓娟#陈继承 \| 《福建农林大学食品科学学院》 \| 2023-02-28 \| 浏览：167 摘要：采用木瓜蛋白酶和糜蛋白酶双酶联合水解坛紫菜蛋白（Porphyra haitanensis protein，PHP）制备降血压活性肽，测定了经超滤后各个分子质量PHP酶解液清除1,1-二苯基-2-三硝基苯肼（1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl，DPPH）自由基和2,2’-联氮双(3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)（2,2’-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid)，ABTS）阳离子自由基能力、铁离子还原抗氧化能力（ferric ion reducing antioxidant power，FRAP）以及血管紧张素转化酶（angiotensin converting enzyme，ACE）抑制活性。经质谱鉴定和活性肽数据库BIOPEP以及AHTPDB网站查找筛选活性肽，采用分子对接解释多肽抑制ACE机理，并对双酶酶解PHP动力学进行研究。结果表明：经超滤后的8 个分子质量的坛紫菜多肽组分中，＜0.5 kDa的组分具有最高DPPH自由基和ABTS阳离子自由基清除能力，＜1 kDa的组分具有最高FRAP值，而0.5～1 kDa组分IC50值（（2.21±0.28）mg/mL）最低。经查找筛选出14 条降血压肽，其中4 条肽的序列和对接能量分别为AVP（－5.87 kJ/mol）、GPL（－6.13 kJ/mol）、LDY （－7.65 kJ/mol）和LGYL（－7.78 kJ/mol）。酶解动力学模型预测PHP水解度与实验水解度相对误差在10%以下。本实验基于串联质谱与分子对接技术，通过生物信息筛选和体外活性检测从混合多肽中快速鉴定、筛选活性多肽，探究多肽抑制ACE的机理，并建立了描述蛋白可控酶解过程规律的动力学模型，为活性肽的制备提供了参考和借鉴。关键词：坛紫菜血管紧张素转化酶抑制肽分子对接酶解动力学模型下载阅读收藏
生物信息学数据库在医学研究中的应用 [医学] \| 刘银凤#张雷 \| 《大理学院基础医学院病原生物学综合实验室》 \| 2022-12-23 \| 浏览：259 摘要：后基因组时代的到来，使生物信息学的应用范围更加广泛，生物信息学数据库种类不断增多，数量不断增加，功能日趋完善；在一次数据库的基础上大量的生物信息学二次数据库得到了开发和应用，推动了病毒分析、基因识别与预测以及疾病诊断等相关领域的发展。关键词：生物信息学数据库病毒基因疾病综述下载阅读收藏
从生物大数据到知识大发现: 十年进展与未来展望 [技术] \| 张学工#江瑞#汪小我#古槿#陈挺 \| 《清华大学自动化系》 \| 2022-12-01 \| 浏览：142 摘要：生物和医疗大数据的快速大量积累是当今生命科学领域的一个重要特征, 但从这些大数据能否获得关于生命现象规律的重大知识发现, 是人们更关心的关键问题, 也是2005年Science杂志展望的125个最具挑战性问题之一. 本文从新一代DNA测序技术发展以及医学遗传学、合成生物学、精准医学、微生物组学等几个方面, 回顾了近十年来生物大数据的重要发展和已经由此带来的科学进步, 并对未来的发展方向进行了展望。关键词：生物大数据基因组学生物信息学系统生物学组学下载阅读收藏
酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术研究进展及其在生物医学研究中的应用 [其他] \| 李凯旋#徐锋#徐平 \| 《河北大学生命科学学院，河北保定 071002》 \| 2022-11-03 \| 浏览：508 摘要：在酪氨酸磷酸化蛋白质组学的研究过程中，酪氨酸磷酸化位点的富集是最重要的一步。目前常用的富集方法是抗体亲和富集或 SH2 superbinder 富集。此外，通过质谱与生物信息学等技术，可实现大规模酪氨酸磷酸化位点的鉴定。对酪氨酸磷酸化蛋白质组学进行深度覆盖研究，揭示癌症发生发展过程中失调的激酶，将有助于深入理解癌症的发生发展过程；且由于 75%的致癌基因是酪氨酸激酶基因，酪氨酸激酶抑制剂作为抗癌药物受到了越来越多的关注。应用酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术，可以鉴定与癌症等重大疾病相关的酪氨酸激酶，从而帮助找到酪氨酸激酶抑制剂。总之，酪氨酸磷酸化蛋白质组学技术可以在酪氨酸激酶鉴定、酪氨酸激酶抑制剂研究及酪氨酸磷酸化信号通路研究等生物医学领域中得到很好的应用。关键词：酪氨酸激酶酪氨酸磷酸化酪氨酸磷酸化肽段富集精准医学下载阅读收藏