|
[技术] | 贠张君#王慧静#俞仪萱#孙梓宜#姚树坤 |
《1.北京中医药大学；2.中日友好医院 消化内科》 | 2023-02-28 |
浏览：305
摘要：
通过生物信息学技术筛选并分析结直肠癌(colorectal cancer,CRC)与正常组织的差异基因,预测可用于诊断和治疗
CRC 的生物标志物及中药。 从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取 GSE21815、GSE106582、GSE41657 基因芯
片,应用 GEO2R 工具获取差异表达基因( differentially expressed genes,DEGs);应用 DAVID 数据库对 DEGs 进行基因本体论
(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;通过 STRING 数据
库构建蛋白-蛋白互作网络,应用 MCODE、 CytoHubba 插件筛选网络中显著模块及关键基因;分别应用 UCSC、 cBioPortal、
Oncomine 在线数据库对关键基因进行分层聚类、生存分析、Oncomine 分析和临床资料相关性分析;应用 Coremine Medical 数据
库预测作用于关键基因的中药。 共筛选出 284 个 DEGs,其中 146 个上调基因,138 个下调基因。 上调基因显著富集在细胞周
期、NLRs 通路、TNF 信号通路等途径;下调基因显著富集在矿物质吸收、氮代谢、碳酸氢盐在近端小管重吸收等通路。 15 个关
键基因为 CDK1、CDC20、AURKA、MELK、TOP2A、PTTG1、BUB1、CDCA5、CDC45、TPX2、NEK2、CEP55、CENPN、TRIP13、GINS2,
其中 CDK1 和 CDC20 被视为核心基因。 CDK1 和 CDC20 的高表达有着较差的生存预后,并且它们在多种癌症中显著表达,尤
其是乳腺癌、肺癌、CRC;CDK1 和 CDC20 的表达与性别、肿瘤类型、TNM 分期、KRAS 基因突变具有相关性。 预测出治疗 CRC
的潜在中药代表药物有黄芩、半枝莲、紫草等。 CDK1 和 CDC20 的显著表达有助于区分肿瘤组织和正常组织,并与生存预后有
关,有望成为诊断和治疗 CRC 的生物标志物,该研究为将来新型药物的开发提供参考方向。
|
|||||
|
[医学] | 陈万青#李 霓#曹毛毛#任建松#石菊芳#陈宏达#李 江#林春青#于欣阳#崔 宏#代敏#赫 捷 |
《国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院》 | 2022-12-23 |
浏览：139
摘要：
［目的］评价 2013—2017 年度城市癌症早诊早治项目实施情况。 ［方法］ 收集和整理
2013—2017 年度城市居民高风险评估问卷和临床筛查结果，计算各癌种的高风险率、筛查率、
阳性病变检出率。 ［结果］ 2013—2017 年度共 2 679 670 人参与高危风险评估问卷初筛，其中
1 140 854 人评估为高危人群， 高风险率为 42.57%。 高危人群中共实施临床筛查 732 974 人
次，乳腺癌筛查参与率最高(40.25%)，结直肠癌最低(17.25%)。 随着项目进展，各癌症筛查参与
率呈不同程度增加。2013—2017 年度共检出阳性病变数 58 208 例。临床筛查结果显示各癌种
阳性病变检出率依次为 22.23%（女性乳腺），11.36%（肺），3.40%（结直肠），2.18%（肝），1.84%
（食管），0.47%（胃）。 ［结论］ 城市癌症早诊早治项目是降低城市居民主要恶性肿瘤发病率和
死亡率的关键措施，自 2012 年实施以来，成效显著。
|
下载
阅读
收藏